>> создания собственного репозитория, и до автоматизации прикладывания этих патчей, пересборки
> собственный репозиторий совершенно перпендикулярен собственной сборке единичного пакета.
> Какая нахрен автоматизация прикладывания того, что не прикладывается или вообще не написано?

Проблемы того что не написано перпендикулярны сравнению разных типов дистрибутивов.

> есть чей-то патч именно к твоей версии. У меня таких не
> было никогда и вряд ли будут, поэтому мне он неинтересен, как
> и автоматизация этого невероятного явления.

Приложили патч, единично, вручную, к версии 1.1. Завтра вышла версия 1.2, ваш патч от 1.1 к ней подходит, ваши действия? И так каждый раз для каждого пакета? Вот тут и начинает появляться собственный репозиторий и начинаться построение собственного мини-редхэта (или мини-дебиана).

И еще раз, на всякий случай, в 99% случаев никаких патчей не нужно, нужно опции поменять, с тех с которыми мейнтейнер пакета в вашем дистрибутиые решил его собирать, на те что нужны именно вам.