Wavpack, помимо лослесс без ограничений флака, поддерживает качественное лосси кодирование, из вариантов лосси кодирования на битрейте 400+ (не помню сколько и зависит от контента) это лучший из существующих вариантов. На битрейтах среднего качества (256кбпс) и низкого (96кбпс) лучше всего опус из представленных. Я говорю про битрейт wavpack, потому что на более низких битрейтах он, как и opus, подмешивает дизеринг. И нужно учитывать, что опус по своей природе всегда может вносить заметные искажения (он несколько раз кодирует и выбирает наиболее удачную на его взгляд итерацию).

Кодирование 32 битных данных в теории может пригодиться, но на практике такие данные уже хранятся в каком-то подходящем формате, где это необходимо. Из проблем флака припоминаю что-то там из ограничений многоканального аудио. Это может создавать проблемы, при кодировании из какого-нибудь многоканального truehd (кстати, он уже чем-нибудь опенсорсным поддерживается полноценно?).

Alac понятно дело всегда был максимально бесполезен и ничем не поддерживается нормально, только через костыли с ffmpeg.