Сначало, попробуйте присоединисться к базе при помощи MySQL клиента с этой машины ('man mysql'). И посмотрите на что он ругается.

Example SQL script:

CREATE DATABASE pam_mysql;
USE pam_mysql;
CREATE TABLE Authentication (
  AUserName VARCHAR(100)  
,APassword VARCHAR(100)  
,AExpiryDate DATETIME
) TYPE=InnoDB;

Example pam.conf:

<deamon> auth required pam_mysql.so user=root host=XXX.XXX.XXX.XXX db=pam_mysql table=authentication usercolumn=AUserName passwdcolumn=APassword sqllog=0
<deamon> account required pam_mysql.so user=root host=XXX.XXX.XXX.XXX db=pam_mysql table=authentication usercolumn=AUserName passwdcolumn=APassword sqllog=0