>включенной опцией Includes. Кто знает, как поднять производительность Apache, не трогая
Это не самое узкое место в apache, ресурсов CPU может быть вполне достаточно, задержка может быть на этапе чтения с диска (если данных не много можно поместить их в ramdisk или просто увеличить размер I/O буффера) или при нехватке ОЗУ (при нехватке ОЗУ сильно помогает отключение или установка минимального значения для keepalive).
Самое узкое место - скрипты, улучшить ситуацию можно через оптимизацию, использование mod_perl,mod_php, mod_python, FastCGI или просто переписав на Си/С++.
Если Includes используются только для включения статики (вставка хеадера/футера, а не запуска скриптов внутри shtml) можно посмотреть исходник mod_include и выкинуть лишний код, благо написан он достаточно прозрачно, если опыта нехватает есть специальные "mini-ssi" модули только для вставки заголовков.