Для обращения к буферу обмена из командной строки нужно использовать утилиту
xclip (http://sourceforge.net/projects/xclip),
которая помещает в буфер обмена то что приходит через STDIN и выталкивает из
буфера обмена в STDOUT.


Скопировать в буфер обмена: echo "test" | xclip
Вывести содержимое буфера обмена: xclip -o 
Через опцию -sel можно выбрать буфер обмена:
   clipboard (Ctrl+C,Ctrl+X, Ctrl+V или меню Copy/Paste в приложениях),
   primary (средняя кнопка мыши), secondary.


Для вывода содержимого буфера обмена по Ctrl-v в bash, можно использовать .bashrc:

if [ -n "$DISPLAY" ] && [ -x /usr/bin/xclip ] ; then
    # Work around a bash bug: \C-@ does not work in a key binding
    bind '"\C-x\C-m": set-mark'
    # The '#' characters ensure that kill commands have text to work on; if
    # not, this binding would malfunction at the start or end of a line.
    bind 'Control-v: "#\C-b\C-k#\C-x\C-?\"$(xclip -o -selection c)\"\e\C-e\C-x\C-m\C-a\C-y\C-?\C-e\C-y\ey\C-x\C-x\C-d"'
fi