Столкнулся с такой проблемой, что при поднятии VPN соединения по умолчанию у каждого соединения 
MTU равен был 1396. В результате чего не работало большое количество сайтов.

Решение такое.
Сервер Fedora 8, с установленным pptpd.
в скрипт /etc/ppp/ip-up добавил одно условие:

   if [ "${REALDEVICE}" != "ppp0" ]; then
      ifconfig ${REALDEVICE} mtu 1400
   fi

Теперь скрипт выглядит так:

   #!/bin/bash
   # This file should not be modified -- make local changes to
   # /etc/ppp/ip-up.local instead

   PATH=/sbin:/usr/sbin:/bin:/usr/bin
   export PATH
 
   LOGDEVICE=$6
   REALDEVICE=$1

   [ -f /etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-${LOGDEVICE} ] && 
      /etc/sysconfig/network-scripts/ifup-post --realdevice ${REALDEVICE} ifcfg-${LOGDEVICE}

   /etc/ppp/ip-up.ipv6to4 ${LOGDEVICE}

   if [ "${REALDEVICE}" != "ppp0" ]; then
      ifconfig ${REALDEVICE} mtu 1400
   fi

   [ -x /etc/ppp/ip-up.local ] && /etc/ppp/ip-up.local "$@"

   exit 0

PS. Средствами pptpd я не смог установить MTU в нужное значение. Если есть какие либо идеи, 
не поленитесь, поделитесь :)